陳玫君出生於台北,台灣大學圖書館學系畢業,美國南加州大學視覺人類學碩士。1994年開始製作紀錄片,拍攝足跡遍及亞、歐、美、非洲。作品曾在世界主要影展及100多家電視台放映。美國洛杉磯時報及每日綜藝報等均予極高肯定,認為它們「精緻並充滿人文及社會關懷」。曾獲林肯中心及紐約文化局頒發「最傑出亞洲藝術家獎」,也獲得美國女性電影協會頒發「榮譽獎」。陳玫君擔任過洛杉磯現代藝術展評委,美國電影協會 (AFI)影展之選片委員及美國公共電視台之獨立製片 (ITVS) 甄選委員,也曾為哥倫比亞製片場擔任電視紀錄片之製片,並在好萊塢電影中客串演出。
代表作品有:《好萊塢旅店》(1994,阿姆斯特丹紀錄片影展競賽決選,尼昂真實紀錄片影展決選);《梅蘭芳的世界》(2000,柏林影展,溫哥華影展,夏威夷影展等);《少林尤里西斯》(2002,美國PBS電視台《獨立鏡頭》系列,全國艾美獎最佳電視系列);《南管女子》(2007,鹿港龍山寺世界首映,美國哥倫布影展銀克里斯獎);探索台灣洪門幫會的《不能說的江湖祕密》;以台灣觀點講述日本女星李香蘭事蹟的《李香蘭的世界》(2015,舊金山亞洲美術館世界首映,台灣國際女性影展)。
陳玫君的第一部劇情長片是高捷與邱偲琹主演的《林北小舞》,她將所擅長的社會寫實觀察融入在如詩如畫的金門與冷冽的台北都會風景中,以細膩的觸角探討父女情感及幫派中的愛恨情仇,讓演員以最誠摯自然的方式,來演繹一個本土而精緻的動人故事。